Tout propriétaire ou gestionnaire de terrains sur un site Natura 2000 peut bénéficier de « contrats » dès lors qu’il réalise une action qui s’inscrit dans une logique d’entretien, de restauration ou de préservation d’un habitat naturel, d’un habitat d’espèces, ou d’une espèce d’intérêt communautaire.
Pourquoi d’intérêt communautaire ? Car ces milieux et ces espèces sont rares à l’échelle de l’Europe, et que nous avons la responsabilité conjointe de les préserver.
Ces contrats peuvent concerner les milieux forestiers, les milieux agricoles ou tout autre milieu comme les cours d'eau, les zones abandonnées ou non exploitées.
Selon la nature de la parcelle et son usage le propriétaire ou gestionnaire peut prétendre à différents contrats :
| MAEc | Contrat "ni-ni" | Charte Natura 2000 | ||
| Surfaces agricoles |  | | ||
| Surfaces forestières | | | ||
| Autres milieux | | |